M2 ASA - Paléozoologie - TP d’analyse de données
Université de Bordeaux - Année 2025/2026
Frédéric Santos 
Aperçu du cours
Ce court TP (3 heures) vise à donner quelques éléments en statistique inférentielle, notamment sur la définition d’un intervalle de confiance et sur la logique d’un test d’hypothèses, sans trop entrer dans les détails techniques.
Matériel
Les données utilisées pour illustrer ces notions consisteront en huit mesures cranio-mandibulaires prises sur un échantillon de suidés africains actuels. Cet échantillon comprend des mâles et des femelles, des individus de différentes classes d’âge, et des représentants de cinq espèces : Hylochoerus meinertzhageni, Phacochoerus aethiopicus, Phacochoerus africanus, Potamochoerus larvatus, Potamochoerus porcus.
Les 8 mesures sont illustrées en Figure 1, et sont définies comme suit :
- C1 : largeur du crâne au niveau des orbites ;
- C2 : largeur minimale au niveau des lignes temporales ;
- C3 : longueur du neurocrâne ;
- C4 : hauteur de l’occipital ;
- C5 : largeur des condyles occipitaux ;
- C6 : largeur du palais au niveau mésial des dernières dents éruptées ;
- M1 : longueur symphyse mandibulaire ;
- M2 : largeur symphyse mandibulaire.
Le jeu de de données (courtesy Antoine Souron) est disponible en cliquant ici.
Utilisation de R
Les manipulations R resteront relativement basiques, et consisteront essentiellement à exécuter des documents computationnels déjà prêts. Vous pourrez les retrouver directement en ligne.
Pour accéder aux documents computationnels (sous forme de Jupyter Notebooks) :
